某日，一個巨大隕石掉落到了日本富士山附近。人類在隕石內(nèi)部發(fā)現(xiàn)了外星技術(shù)并設(shè)立了專門的機(jī)構(gòu)對其進(jìn)行解析。10年后的某日，外星人ワーキュリー到地球搶奪隕石，而同時人渣教師羽柴當(dāng)吉也在打隕石的主意，并強(qiáng)迫他的八個學(xué)生去啟動隕石內(nèi)部的儀器，結(jié)果超級機(jī)器人ガクセイバー就由隕石中誕生了……ガクセイバー由腦波操縱，武器則都靠駕駛員自己的想象力來生成。在漫畫版中機(jī)體的顏色是藍(lán)，但由于OVA的主戰(zhàn)場是宇宙，為了能和背景對比而改成了紅色。
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