前作『銀河旋風(fēng)ブライガー』のラストで語られたカーメン?カーメンによる大アトゥーム計(jì)畫（木星爆破による新惑星の大量創(chuàng)造）から600年、時(shí)代は28世紀(jì)を迎えていた。人類は地球軌道上に35の植民惑星を築いて移り住み、星々は太陽系管理機(jī)構(gòu)ドメスチック?バクーフ（モデルは幕府）によって統(tǒng)治されていた。しかし、メリーカ（モデルはアメリカ）?エンゲーレス（モデルはイギリス）?ランス（モデルはフランス）等の外宇宙艦隊(duì)（異星人）との接觸をきっかけにバクーフ統(tǒng)治體制の弱體化が露見、ロングー（モデルは長州藩）?ゴワハンド（モデルは薩摩藩）?トルサ（モデルは土佐藩）等の反體制派の惑星が臺(tái)頭するなど、太陽系は混迷を極めていた。そんなある日、伝説のJ9に憧れるドン?コンドールらは、太陽系で一旗上げるべく仲間達(dá)と共に「銀河烈風(fēng)隊(duì)」を結(jié)成する。銀河烈風(fēng)隊(duì)は、バクーフのリーダーである総將軍アーウィン14世の護(hù)衛(wèi)を務(wù)めたのをきっかけに、バクーフ特別警備隊(duì)に組み込まれ、闇の武器商人スリーJから手に入れた巨大ロボット?バクシンガーを駆り、反バクーフ勢(shì)力と戦う事になる。