故事講述在町田的住宅地附近，由于大范圍的地盤下沉產生了巨大的“穴”。同時，居住在當?shù)氐?85家人家無一例外地被殘忍的殺害。迷一般的恐怖殺人事件一件一件發(fā)生，怎么看也不像是人類乾出來的，卻一點線索也沒有。這些事件似乎和一個迷之老人以及一個被稱為禁忌之遺物的“ドゥルジ之箱”有著什么關聯(lián)。
過了5年，近未來的東京。表面上看上去是座繁榮的巨大都市，實際上卻已經走向了毀滅的邊緣。兩極化，犯罪都市。町田慘劇中唯一一個生還者申道蘭丸，為了尋找事件的真相成為了警察。
然后，新的案件還是在澀谷發(fā)生了。有報道稱，這是一個吸毒者的狂暴案件，但在申道等警察趕到現(xiàn)場時，眼前清楚的看到正在蹂躪人的妖獸。上前救人的是特殊機動搜查隊2課，特殊公安部，通稱“特公”的隊員，六條櫻她們。她們的武器既不是槍也不是警棍，而是用來斬殺妖獸的太刀。
申道終于明白日本將在2年內毀滅，于是走上了和妖獸戰(zhàn)斗的悲慘道路……