電視動畫《神無月的巫女》改編自日本漫畫家介錯原作的同名漫畫。2004年6月22日，《神無月的巫女》動畫官網開啟。在漫畫雜志《月刊少年Ace》2004年8月號（6月26日發(fā)售）上，正式發(fā)表了《神無月的巫女》TV動畫化的決定。電視動畫于2004年10月1日首播，全12集。
遠古之神"大蛇"企圖滅世，因而產生了兩位救世巫女。兩位巫女經由不停地輪回轉世，相遇后以兩人之力封印住大蛇。而原本只是普通高中生、卻為"日之巫女“轉世的來棲川姬子以及"月之巫女"的轉世姬宮千歌音，為了再次封印大蛇，不得不想辦法召喚傳說中的劍神"天之叢云"。大蛇的八個仆人們(人性的八個黑暗面)為阻止兩人召喚天之叢云，而屢次對她們發(fā)動襲擊；這時，原本應該是"大蛇"之一、排名順序七的大神相馬因為暗戀姬子已久，而背叛了大蛇的意志，屢次地拯救她們，但卻又引發(fā)了另一場風波。不停輪回的兩人，無法分離的命運，這是身為“神無月之巫女”的命運。