宋慈（何冰 飾）參加京試中了進士，預備返家完婚后隨同科好友孟良臣（吳軍 飾）赴邊城。豈知，直至完婚那日，宋慈父親宋鞏依舊未歸家。兩位新人正拜堂之際，一輛馬車卻載回了父親的遺體，宋鞏一生從事刑獄審戡，從未出錯，卻因一次誤判人命功虧一簣，這是以死謝罪，還留下遺書禁止宋門后代涉足刑獄。
豈料，禍不單行，孟良臣在上任途中被謀殺的噩耗傳回。在母親的勸導下，宋慈動身邊城，為摯友查明了案情，還它清白。由此，宋慈被破格提升為大理寺正六品主事，后又被任命外省提點刑獄。宋慈接連查明偵破了“太平縣冤案”、“李府連環(huán)案”、“毛竹塢無頭案”、“城南井尸案”、“遺扇嫁禍案”、“梁雨生命案”、“李玉姑失蹤案”等一樁又一樁的懸案……
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